在回答这个问题之前，首先我们来看看他们各自的优势和劣势。
App优势:
1.用户使用体验好
页面的渲染过程发生在客户端，与服务器后端交互数据量小，加载速度快，并且可以使用各种动画效果，使得用户在使用过程中得到良好的体验。
２.独立性好
不必依赖于微信平台，在用户手机上独立存在，直接在桌面展示，推送信息直接到达用户，不受第三方约束。
３.彰显企业，平台或品牌实力
大型的企业，平台或品牌无一例外不会在App领域缺席。
App劣势：
1.开发和维护成本高
高质量的App开发，无论是自建团队还是寻求外包，对技术团队要求相对较高，成本高于微信公众号H5。后期的维护升级需要兼顾用户手机上的旧有数据，同样考验技术实力。
2.获客成本高
需要强有力的推广工作，才能获得下载机会和驻留在用户手机的机会，并且辅以各种运营手段，确保不会成为僵尸应用。
3.占用手机内存
不但需要占用手机存储容量，同时低质的App在后台可能偷偷吃掉大量用户内存。
微信公众号H5优势：
1.开发和维护成本相对较低
优秀的前端开发人员可以快速的进行H5开发，重点需要解决微信内核浏览器的兼容性问题
2.推广优势
借助微信这款强大的社交App的用户量和生态体系相对App来说更易推广，微信朋友圈海量的微商就是这么来的
3.占用内存少
借助微信App, 微信公众号H5不需要进行安装，用户直接浏览，之后可以通过清理微信缓存释放空间。
微信公众号H5劣势：
1.用户体验不如App
微信公众号H5需要从服务器端加载页面文件，加载速度，使用体验都逊于App
2.窗口效果
因为微信公众号H5存在于微信内部，无法在用户手机中获得一级入口。大量的公众号和微信联系人可能使你的微信公众号H5泯然众人也。
3.受制于微信
微信公众号H5受到腾讯直接管制，涉及腾讯自身利益或关切的一些行为可能带来你的公众号被封杀或者禁用。
上面我们简述了两者的主要优势劣势，那我们如何进行选择呢？
首先两者并非鱼与熊掌，取长补短，配合使用能达到最佳效果，如果说非要两者二选一的话，可以从产品定位来选择，如果你的产品倾向于媒体型，内容运营，轻度服务，那微信公众号H5更适合你，如果你的产品有复杂的功能，绚丽的UI, 沉浸式体验，那App更适合你。
初创的小型企业，在产品定位方面还不太确定，在意成本控制，那么先微信公众号H5再App更适合你。如果你的定位非常清晰，想一炮而红，并且具备一定的资金储备，那直接做App开发也未尝不可。
大型公司，平台，品牌，同时兼顾微信公众号H5和App, 用微信公众号H5做流量吸引，粉丝经营，用App做用户体验，产品服务。
团队由资深互联网专家组成，服务内容类涵盖软文发布、软文代写、微信营销、微博营销、视频置顶、百度问答等多种互联网广告行业。发稿网平台有上千媒介编辑、专业写手、段子手、营销专家，为企业、公共机构和个人提供定制化的解决方案，将创意、智慧、技能转化为商业价值和社会价值。发稿网平台凭借多年的网络资源和客户资源积累，发展遥遥领先同行业其他软文平台。